在配置流動相時，應避免以下壞習慣，這些習慣可能會導致液相色譜係統汙染：
1. 在添加有機相後測量流動相的pH值：在水溶液中，pH值被校準以提供正確的pH值。如果你用添加了有機相的水溶液來測量pH值，pH值就會與有機相添加前的pH值不同。
2. 不使用緩衝鹽：緩衝鹽的加入是用來控製和修正流動相中PH值的改變的。樣品基質、空氣中的CO2、水中的雜質都會造成流動相PH值的改變，而PH值的改變會影響樣品的保留、峰形、峰麵積參數。
3. 沒有在正確的緩衝區間使用緩衝鹽：每個緩衝鹽都有一定的緩衝範圍，在此範圍內它提供了最佳的pH穩定性。在這個範圍外，緩衝鹽在抵抗pH值變化方麵是無效的。所以要麽在正確的範圍內使用緩衝鹽，要麽選擇一個緩衝範圍覆蓋所需pH值的緩衝鹽。
4. 向有機相中加入緩衝鹽：如果將水相的緩衝溶液加入到有機相中，會大大增加緩衝鹽析出的風險。緩衝鹽的析出在初期可能並不明顯，但會對儀器的各個部件都會產生一定影響。
5. 梯度洗脫時直接用泵去混合流動相並且流動相比例從0%開始：現在的液相色譜能夠非常高效的進行在線脫氣和流動相混合。但是將梯度洗脫比例從0%開始，會有比較大的出現氣泡和沉澱的風險。
6. 沒有使用正確的pH值修飾酸或堿作為緩衝液：緩衝溶液的修飾酸或堿，隻使用生成緩衝鹽的酸或堿。例如，磷酸鈉緩衝液隻能用磷酸或氫氧化鈉調節。
7. 沒有在方法中說明緩衝液的全部信息：例如隻在方法中寫“稱5克磷酸鈉溶入1000毫升水”。緩衝鹽的類型決定其pH緩衝範圍，而緩衝鹽中所需物質的濃度決定了緩衝強度。例如:5g的無水磷酸鈉和5g的一水磷酸鈉具有不同的緩衝強度，會影響保留率。
8. 使用儀器時不調查之前使用的流動相情況，直接用純有機溶劑衝係統：如果之前的方法在B通道使用緩衝溶液，而這次沒有經過調查就直接在B通道使用了純的有機溶劑，那麽就會造成該通道緩衝鹽析出、出現堵塞等風險。
9. 將溶劑瓶中的流動相用幹為止：溶劑瓶中的流動相如果用幹，會導致儀器中出現氣泡等問題。
10. 僅使用超聲來給流動相脫氣：超聲脫氣有一定的脫氣作用，但完全脫氣的效果並不理想。所以在此建議使用真空脫氣機進行在線脫氣。
